常州大学高等教育研究院成立于2015年1月，作为校级文科实体研究机构，主要承担有关高等教育问题的理论和实践研究、本校改革发展的调研和咨询等任务。

常州大学产教融合创新发展研究院成立于2023年11月，成立之初挂靠教务处。

2024年8月，常州大学产教融合创新发展研究院、常州大学高等教育研究院合署，成为独立的正处级研究机构。

研究院主要为贯彻落实党的二十大、二十届三中全会关于“统筹推进教育、科技、人才体制机制一体改革”的重要精神，围绕学校中心工作做好以科教融汇、产教融合为重点的高等教育资政服务、理论研究和实践应用，打造常州大学“产教融合”的品牌特色，为全面建成特色鲜明的高水平地方领军型大学贡献力量。